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[文獻(xiàn)快訊] 優(yōu)化預(yù)分析方法改善非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)中的KRAS突變檢測(cè)
2017-12-18 00:00來(lái)源:原版作者:JL Sherwood.et al.
文章出處:《Plos One》 , 2016 , 11 (2) :e0150197
文章導(dǎo)讀:
介紹:使用循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)的非侵入性突變檢測(cè)是有吸引力的前提。這可以使沒(méi)有腫瘤樣本的患者獲得更多的治療選擇。
材料和方法:從45名NSCLC患者分析外周血和匹配的腫瘤。我們調(diào)查了預(yù)分析變量對(duì)DNA產(chǎn)量和/或KRAS突變檢測(cè)的影響:樣品收集管類(lèi)型,溫育時(shí)間,離心步驟,血漿輸入體積和DNA提取試劑盒。
結(jié)果:2小時(shí)的孵育時(shí)間和雙倍血漿離心(2000xg)降低總體DNA產(chǎn)量,導(dǎo)致污染的基因組DNA(gDNA)水平降低。抽血后72小時(shí),與EDTA管相比,使用無(wú)細(xì)胞DNA血液采集管(cfDNA BCT)觀察到減少的“污染”和增加的KRAS突變檢測(cè)。血漿輸入量和使用不同的DNA提取試劑盒影響DNA產(chǎn)量。
結(jié)論:這項(xiàng)研究表明,NSCLC突變檢測(cè)成功的ctDNA恢復(fù)取決于預(yù)分析步驟。建議開(kāi)發(fā)從ctDNA樣本檢測(cè)KRAS突變的標(biāo)準(zhǔn)方法,以盡量減少預(yù)分析步驟對(duì)突變檢測(cè)率的影響。在不能快速進(jìn)行樣品處理的地方,使用cfDNA BCT管將是有利的。
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