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首頁 專家論壇 標(biāo)本專家[文獻(xiàn)精讀] 對在子宮內(nèi)膜癌的研究中所使用的生物樣品庫的標(biāo)準(zhǔn)的協(xié)調(diào)
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[文獻(xiàn)精讀] 對在子宮內(nèi)膜癌的研究中所使用的生物樣品庫的標(biāo)準(zhǔn)的協(xié)調(diào)

2017-11-17 00:00來源:原版作者:Adishesh M. et al.


導(dǎo)讀: 本期的文獻(xiàn)通譯是一篇關(guān)于生物樣品庫的專業(yè)文章。 生物樣品庫對現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展, 尤其是生物標(biāo)記物的開發(fā)和確認(rèn), 對于個(gè)體化醫(yī)療的推廣, 以及對于我們所關(guān)注的液體活檢領(lǐng)域的發(fā)展, 都起到了越來越多的支撐作用。 但是生物樣品庫也面臨著瓶頸, 最顯著的就是生物樣品庫種類繁多, 標(biāo)準(zhǔn)混亂。 本文闡述了建立生物樣品庫的過程, 它從方法學(xué)開始, 針對一個(gè)專一的癌癥病種,通過文獻(xiàn)、咨詢、協(xié)商和統(tǒng)計(jì)分析, 明確提出了采集樣品和數(shù)據(jù)的若干工具, 并參照地區(qū)、國家和國際的標(biāo)準(zhǔn), 對新建的生物樣品庫的標(biāo)準(zhǔn)作出harmonisation, 就是協(xié)調(diào)標(biāo)準(zhǔn)以達(dá)共識。 生物樣品庫的規(guī)范化, 必然將其推向獨(dú)立發(fā)展的學(xué)科和業(yè)務(wù)領(lǐng)域, 值得陽普這樣的樣品專家的關(guān)注和跟蹤。 


原文出處

British Journal of Cancer (2017) 117, 485-493


作者

M Adishesh1,2, A Fyson2, S B DeCruze1, J Kirwan1, ENITEC Consortium, H M J Werner3,4 and D K Hapangama*,1,2


作者信息

Liverpool Women’s Hospital NHS Foundation Trust, Crown Street, Liverpool L8 7SS, UK; Department of Women’s and Children’s Health, Institute of Translational Medicine, University of Liverpool, Liverpool Women’s Hospital, Crown Street, Liverpool L8 7SS, UK; 3Department of Obstetrics and Gynaecology, Haukeland University Hospital, Jonas Liesvei 70, 50503 Bergen, Norway and 4Department of Clinical Science, University of Bergen, Bergen 5021, Norway


摘要
 

背景:子宮內(nèi)膜癌是最常見的婦科癌癥,預(yù)計(jì)其發(fā)病率到2025年將上升50-100%,相關(guān)死亡率也將相應(yīng)增加。生物學(xué)樣本的收集、處理和儲存過程中的是否一致會影響到科學(xué)數(shù)據(jù)的普遍性。本旨在協(xié)調(diào)與子宮內(nèi)膜癌相關(guān)的生物樣本以及臨床數(shù)據(jù)的收集,并制定收集、處理和儲存子宮內(nèi)膜癌生物樣本的標(biāo)準(zhǔn)操作程序。

方法:我們設(shè)計(jì)了通過三個(gè)共識輪次進(jìn)行評估和修訂的研究工具,以獲得地方/區(qū)域、國家和歐洲的共識。修改的最終工具被傳播給代表子宮內(nèi)膜癌研究的所有利益相關(guān)者的小組(n = 40),以達(dá)成共識。

結(jié)果:最終的共識表明與最小的手術(shù)和患者數(shù)據(jù)收集工具的一致同意。另外還有其他標(biāo)準(zhǔn)工具的高度一致意見。

結(jié)論:我們在這里介紹了所有子宮內(nèi)膜癌研究人員可以免費(fèi)使用的工具的最終版本。我們認(rèn)為,這些工具將促進(jìn)子宮內(nèi)膜癌研究的快速進(jìn)展,無論是在未來的合作還是大規(guī)模的多中心研究中。


背景介紹 

子宮內(nèi)膜癌(EC)是發(fā)達(dá)國家女性生殖道最常見的癌癥,是乳腺癌、肺癌和結(jié)腸直腸癌后女性第四大常見癌癥(Ferlay等,2015)。在2014年,英國每天至少有6名婦女死于子宮內(nèi)膜癌,同時(shí)有21名婦女被診斷患有子宮內(nèi)膜癌。歐共體每年有9022例新發(fā)病例和2166例死亡病例(CRUK)。 EC的發(fā)病率迅速增加,預(yù)計(jì)到2025年將增加50-100%(Lindemann等,2010)。這種發(fā)病率的上升令人震驚,特別是由于死亡率相應(yīng)上升(CRUK)。因此迫切需要更多地努力尋找新的預(yù)防,診斷,預(yù)后和治療目標(biāo),以降低與歐共體相關(guān)的高死亡率和發(fā)病率。傳統(tǒng)上,使用基于福爾馬林固定石蠟包埋組織的免疫組織化學(xué),僅允許同時(shí)研究有限數(shù)量的蛋白質(zhì)。雖然其他細(xì)胞系和動物研究已被應(yīng)用于歐共體研究, 但是這些很少提供體內(nèi)人體環(huán)境的完美模擬。因此,收集廣泛的不同患者標(biāo)本(包括例如新鮮的冷凍組織,尿液,血液或唾液)的生物庫在為臨床相關(guān)科學(xué)發(fā)現(xiàn)提供有價(jià)值的患者材料方面起著至關(guān)重要的作用,也有助于快速翻譯基礎(chǔ)科學(xué)發(fā)現(xiàn)臨床實(shí)踐。

通過其特殊性質(zhì),存儲在生物樣本中的患者材料使研究EC的多個(gè)方面成為可能。隨著基因組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué),表觀基因組學(xué)和代謝組學(xué)等新技術(shù)平臺的出現(xiàn),這些技術(shù)平臺可以統(tǒng)一并同時(shí)應(yīng)用于相同的患者樣本,以獲得最大限度的信息,這一點(diǎn)至關(guān)重要。預(yù)期這種全面的方法將大大減少新的基礎(chǔ)科學(xué)發(fā)現(xiàn)以新的治療方式接觸患者所花費(fèi)的時(shí)間,并允許患者捐贈的樣品被充分利用。

生物樣本庫所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)的內(nèi)部和外部的有效性取決于其質(zhì)量,這顯然取決于嚴(yán)格標(biāo)準(zhǔn)在收集生物樣本和患者特征方面的使用。與收集,處理,存儲不同生物樣本和伴隨的表型和人口統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)相關(guān)的變化使得極其難以推斷或合并來自不同研究的數(shù)據(jù)(TworogerHankinson,2006; RansohoffGourlay2010)。國家癌癥研究所(NCI)認(rèn)為缺乏質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和統(tǒng)一性是癌癥研究的障礙(NCI最佳實(shí)踐,2011年生物世界資源)。標(biāo)本和數(shù)據(jù)收集中的不規(guī)則性和不相似性所引起的不可逆轉(zhuǎn)的偏見得到許多人的認(rèn)可,許多國際組織和機(jī)構(gòu)正在努力克服這一點(diǎn)(Morente等人,2007;國際生物與環(huán)境儲存學(xué)會,2008; Yuille等,2008; Vaught and Lockhart,2012)。

鼓勵優(yōu)化可用于癌癥研究的資源的生物樣品庫NCI最佳實(shí)踐指南(NCI Best Practices for Biospecimen Resources,2011年,2016年)廣泛提及與捐贈者或樣本收集/處理相關(guān)的預(yù)分析變量的有限列表。從而有效提高了涉及生物樣本的研究的整體意識和質(zhì)量。


雖然這是一個(gè)重要的開始,但許多參數(shù)和變量,包括生物樣本和臨床數(shù)據(jù)的選擇,都是癌癥型特異性的。因此,普遍的生物網(wǎng)路化標(biāo)準(zhǔn)不一定適用于每種癌癥類型,并且應(yīng)適應(yīng)于每種特定疾病。癌癥基因組圖譜(Kandoth et al,2013)強(qiáng)調(diào)了癌癥特異性協(xié)調(diào)生物樣品庫業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的重要性,該基因組圖譜現(xiàn)在包含超過532個(gè)具有RNA測序,拷貝數(shù)變異,蛋白質(zhì)組學(xué),突變和微陣列數(shù)據(jù)的ECO樣品。然而,這些樣本和數(shù)據(jù)集中大部分的臨床數(shù)據(jù)非常有限,嚴(yán)重影響了研究人員繪制臨床適用信息的能力。


因此,EC特異性標(biāo)準(zhǔn)化采集具有獨(dú)特和相關(guān)的臨床數(shù)據(jù)集的生物樣本是改善未來EC研究的根本未滿足的需求。我們相信,這將有助于未來對EC的大規(guī)模國際合作研究,這可能導(dǎo)致改進(jìn)的生物標(biāo)志物和靶標(biāo)治療發(fā)現(xiàn)。子宮內(nèi)膜異位癥 - 世界子宮內(nèi)膜異位癥研究基金會子宮內(nèi)膜異位癥和生物樣品庫協(xié)調(diào)項(xiàng)目和卵巢癌研究計(jì)劃(Wiegand et al,2010; Heravi-Moussavi et al,2012; Fassbender et al, 2014; Rahmioglu等,2014; Vitonis等,2014)。

有了這個(gè)背景,我們開始了研究(Harmanization of biobAnking Standards in Endometrial caNcer research -  HASTEN),以達(dá)成EC研究人員的共識;規(guī)范所有相關(guān)生物樣本的收集,處理和儲存;以及通過與患者,外科醫(yī)生/醫(yī)師/病理學(xué)家和生物工程人員的共同努力進(jìn)行EC研究的隨附臨床數(shù)據(jù)。我們旨在制定標(biāo)準(zhǔn):標(biāo)準(zhǔn)操作程序工具,最小和標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集將定期更新,并普遍適用于EC的未來研究人員。


材料和方法

        流程圖總結(jié)了用于設(shè)計(jì)HASTEN中最終工具的方法(圖1)。我們使用修改后的德爾福系統(tǒng)來分析和確認(rèn)最終的共識。

我們的生成初始工具的過程起始于文獻(xiàn)檢索。我們使用關(guān)鍵詞“子宮內(nèi)膜癌”,“危險(xiǎn)因素”,“介紹年齡”,“平等”,“絕經(jīng)狀態(tài)”,“二甲雙胍”,“孕激素或曼月樂”,“激素替代療法” '多囊卵巢綜合征','他莫昔芬','腸癌','結(jié)腸直腸癌','乳腺癌','糖尿病','高血壓','種族','人體測評','吸煙' “子宮內(nèi)膜”,“血液或血漿或血清”,“唾液”,“尿”,“子宮內(nèi)膜液”,“腹膜液”,“生物樣品庫最佳實(shí)踐”組織病理學(xué)標(biāo)志物,“結(jié)果” ',“組織,血液和體液的實(shí)驗(yàn)室處理程序”,“生物分類標(biāo)準(zhǔn)”,“收集組織、液體、血液、唾液、尿液的SOP”,用以上的關(guān)鍵詞搜索了Scopus,Discover和PubMed數(shù)據(jù)庫。文獻(xiàn)搜索僅限于過去10年發(fā)表的研究。在初步搜索中確定的3464篇論文中,根據(jù)以下納入標(biāo)準(zhǔn),選擇了413篇文章進(jìn)行進(jìn)一步的詳細(xì)審查:


(1)調(diào)查上述因素如何影響個(gè)人發(fā)展EC風(fēng)險(xiǎn)的論文。

(2)提出標(biāo)準(zhǔn)操作程序(SOP)或收集,儲存和加工不同組織或液體的最佳做法的出版物。

(3)只有英文的論文。

(4)可通過所有可用資源向作者提供論文(例如,利物浦婦女醫(yī)院(LWH),利物浦大學(xué),英國醫(yī)學(xué)協(xié)會或皇家婦產(chǎn)科學(xué)院的在線資源或圖書館設(shè)施。

我們進(jìn)一步對這些選定論文中引用的相關(guān)手稿進(jìn)行手動搜索,并從大型生物解毒劑中進(jìn)行相關(guān)指導(dǎo)。


工具的進(jìn)一步開發(fā)


首次當(dāng)?shù)刈稍?。利物浦的?dāng)?shù)貓F(tuán)隊(duì)由四名外科婦科腫瘤學(xué)小組成員組成,四名麥克米倫臨床癌癥護(hù)士專家,兩名對EC研究感興趣的臨床學(xué)者,兩名病理學(xué)家,兩名生物工作人員和一名醫(yī)學(xué)生,開發(fā)出三種形式患者數(shù)據(jù)收集工具,手術(shù)數(shù)據(jù)收集工具,生物樣本表格)和標(biāo)準(zhǔn)手術(shù)程序。這些形式和SOP基于:(a)文獻(xiàn)搜索中收集的信息; (b)由

考慮到LWH /利物浦大學(xué)生物庫中已經(jīng)使用的形式,用于收集EC研究中的生物樣本和數(shù)據(jù)。利物浦婦女醫(yī)院是婦科癌癥的高等轉(zhuǎn)診區(qū)域癌癥中心,是柴郡和默西塞德戰(zhàn)略臨床網(wǎng)絡(luò)的一部分,為240萬人口提供服務(wù)。默西塞德郡和柴郡癌癥網(wǎng)絡(luò)的EC年齡標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)病率為18.3 / 10萬女性成員(NCIN,2013; Gynae Clinical Network Constitution,2014-2015)。 (c)由國立衛(wèi)生研究院,人子宮內(nèi)膜組織和DNA銀行開發(fā)的用于收集,運(yùn)輸和儲存子宮內(nèi)膜組織和進(jìn)行子宮內(nèi)膜活檢或子宮切除術(shù)的非惡性指征的女性血液樣本的標(biāo)準(zhǔn)操作程序(Sheldon等,2011)。 (d)英國生物庫公布的收集尿液和血液樣本的樣品處理和儲存方案(Elliott等,2008)。英國生物樣品庫是維康信托,醫(yī)學(xué)研究理事會,衛(wèi)生部,蘇格蘭政府和西北地區(qū)發(fā)展局成立的國家和國際重要衛(wèi)生資源。

其主要目的是改善癌癥,心臟病,中風(fēng),糖尿病,關(guān)節(jié)炎,骨質(zhì)疏松癥,癡呆等許多疾病的預(yù)防,診斷和治療。

二次區(qū)域/國家磋商。上述三種形式的修改版本和上述SOP在聯(lián)合王國參與歐共體研究的三個(gè)區(qū)域和八個(gè)國家研究中心之間傳播,形式修訂整合了其反饋,結(jié)果是兩種不同的工具,一種是最小的和一種開發(fā)了標(biāo)準(zhǔn)工具。這種務(wù)實(shí)和包容性的方法為考慮可用資源收集最小或理想的“標(biāo)準(zhǔn)”數(shù)據(jù)集提供了指導(dǎo)。


第三次歐洲咨詢。然后將修改后的表格分發(fā)給所有堅(jiān)持歐洲子宮內(nèi)膜癌個(gè)性化治療網(wǎng)絡(luò)(ENITEC)的研究人員,并根據(jù)收到的反饋進(jìn)一步修訂。修訂的工具在2016年6月的年度ENITEC面對面會議上提出,最小形式得到所有47名與會者的一致通過。對標(biāo)準(zhǔn)工具進(jìn)行了一些進(jìn)一步修改,并作了相應(yīng)修訂,修訂后的表格重新填補(bǔ)了所有參加第1-3次磋商的情況,得到最后的批準(zhǔn)。


達(dá)成共識。 共識一代修改后的Delphi系統(tǒng)被用于對最終的修改工具產(chǎn)生共識。為此,將這些表格傳播給代表所有前幾輪所有利益相關(guān)者的一組選定小組成員,包括患者,

婦科腫瘤學(xué)家,研究人員,病理學(xué)家和生物工作人員,從咨詢參與者(n = 40)隨機(jī)選擇使用記錄他們的協(xié)議的評分表評估和評分工具。


統(tǒng)計(jì)分析。使用修改的德爾菲技術(shù)對共識進(jìn)行了量化,我們已經(jīng)報(bào)告了中位數(shù)為四分位數(shù)范圍,并且還有Likert量表的每個(gè)類別的百分比。使用了九分李克特量表,除了患者數(shù)據(jù)工具,其量表減少到五點(diǎn),以減少患者的復(fù)雜性。


結(jié)果


本研究的最終工具是ECPD收集工具。我們設(shè)計(jì)了一種耐心友好的數(shù)據(jù)收集工具(EC患者數(shù)據(jù)(ECPD))來捕獲與EC研究直接相關(guān)的許多重要人口統(tǒng)計(jì)學(xué)變量,只能由患者自己準(zhǔn)確回憶。例如,現(xiàn)有的文獻(xiàn)表明420 kg與EC增加風(fēng)險(xiǎn)獨(dú)立相關(guān)的成人體重增加(Friedenreich et al。,2007)和這種信息不可能直接從患者身上獲得。 EC的許多其他危險(xiǎn)因素,如介紹年齡,絕經(jīng)后狀態(tài),多囊性卵巢疾?。‵earnley等,2010),無效性(Schonfeld等,2013),月經(jīng)初潮(Gong等,2015),家庭遺傳性疾病綜合征性癌癥的歷史(Boilesen等人,2008),過去的疾病綜合征相關(guān)癌癥病史,糖尿病等醫(yī)學(xué)病癥(Friberg等,2007),先前使用他莫昔芬(Bergman等,2000),激素替代療法使用(Beral等人,2005年)和運(yùn)動習(xí)慣已被納入該工具。目前還有一些其他因素與目前的EC(如Lindemann等人,2008)沒有任何聯(lián)系,因?yàn)樗麄冊诮窈蟮难芯恐锌隙诉@一點(diǎn)。表1和圖2說明了最后一輪協(xié)商一致的結(jié)果。 

ECPD中每個(gè)問題的得分使用Likert量表獲得,Likert量表評估可接受性和可用性(n = 10)。在小組成員中,只有2%在社會歷史部分的問題清晰度方面未定,總共98%的患者同意該工具易于使用。

ECSD收集工具。 EC手術(shù)數(shù)據(jù)(ECSD)工具包括突出的人口統(tǒng)計(jì)學(xué),組織學(xué)和術(shù)前/術(shù)后特征。包括人體特征如體重指數(shù)(BMI)。選擇身體質(zhì)量指數(shù)代替腰臀比或腰圍,因?yàn)槠淦毡槭褂煤椭噩F(xiàn)性。盡管所有人體測量(BMI,腰臀比,腰圍和臀圍周圍)都被發(fā)現(xiàn)與EC風(fēng)險(xiǎn)增加密切相關(guān)(Friedenreich等,2007),腰臀比或腰圍的準(zhǔn)確數(shù)據(jù)需要額外的努力使用醫(yī)療團(tuán)隊(duì)相同的參考點(diǎn),因此準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)收集不可能普遍可行。在最近的一項(xiàng)研究(Painter等,2016)中,BMI被發(fā)現(xiàn)是一個(gè)因素,與EC與腰臀比相關(guān)。術(shù)前成像細(xì)節(jié)有助于評估局部擴(kuò)散和排除遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。子宮內(nèi)膜活檢和最終組織學(xué)結(jié)果之間的差異已被證明與較差的生存結(jié)果相關(guān)(Werner等,2013;因此,術(shù)前活檢結(jié)果很重要。與結(jié)果相關(guān)時(shí),手術(shù)后的分期細(xì)節(jié),包括手術(shù)結(jié)果和最終組織病理學(xué)細(xì)節(jié)是重要的。免疫組織化學(xué)生物標(biāo)志物可用于區(qū)分卵巢癌,子宮頸癌或其他惡性腫瘤,但重要的是與臨床預(yù)后相關(guān)的預(yù)后生物標(biāo)志物(Li等,2013; Kamal等,2016)。以標(biāo)準(zhǔn)方式與生物樣本一起收集的信息自然會增加生成數(shù)據(jù)的內(nèi)部和外部有效性。應(yīng)定期更新患者資料,包括隨訪和準(zhǔn)確記錄死亡原因,直至完成標(biāo)準(zhǔn)隨訪期(3年(至少)或5年,視當(dāng)?shù)貙?shí)踐而定)。表格分為三個(gè)部分:

            (1)手術(shù)資料:收集樣本時(shí)完成。

            (2)組織病理學(xué)細(xì)節(jié):最終分期治療后完成。

            (3)結(jié)果數(shù)據(jù):在隨訪期間記錄,最后在隨訪結(jié)束時(shí)記錄。

 

最終共識的結(jié)果如表2和圖2所示,其中我們用四分位數(shù)范圍計(jì)算了中位數(shù)。所有小組成員的小組成員之間達(dá)成了高度的一致意見,但一些答復(fù)者認(rèn)為有關(guān)歷史,先前活檢細(xì)節(jié)和樣本收集細(xì)節(jié)的部分不相關(guān)。總體來說,96.25%的小組成員同意該工具的不同方面(補(bǔ)充圖S1)。




EC生物樣本工具。收集方法和生物樣品庫條件(處理和儲存)的變化可能改變生物標(biāo)志物分布的分子組成,表達(dá)和穩(wěn)定性(Zander等,2014); 因此,一致性和嚴(yán)格遵守標(biāo)準(zhǔn)操作程序至關(guān)重要(Moore等,2011)。因此,具有臨床生物樣品庫應(yīng)用經(jīng)驗(yàn)和知識的生物工作人員參與了生物樣本形式的設(shè)計(jì),修訂和獲得最終共識。只有少數(shù)受訪者認(rèn)為形式的組織處理(子宮和宮外)部分難以理解,而所有受訪者都同意所有其他部分的相關(guān)性和清晰度??傮w來說,這個(gè)工具的不同方面達(dá)成了94%的協(xié)議。詳細(xì)結(jié)果如表3,圖2和補(bǔ)充圖S1所示。


用于EC研究的組織和液體的收集,加工和儲存的標(biāo)準(zhǔn)操作程序。 EC研究中研究了不同組織類型(子宮和宮外)和體液類型。這些生物樣本的常規(guī)研究可能涉及使用蛋白質(zhì)組學(xué),基因組學(xué)和代謝組學(xué)等多種技術(shù)提取待評估的蛋白質(zhì),RNA和DNA。最終的SOP設(shè)計(jì)合并了許多可用的單獨(dú)的詳細(xì)方法方案(例如,用于離心,過濾,添加防腐劑以及儲存溫度)。從生物庫獲得這些信息將使科學(xué)家能夠準(zhǔn)確地解讀其數(shù)據(jù),例如檢查血液,組織,子宮內(nèi)膜液或抽吸物等樣品的代謝特征,并自信地檢測疾病特異性變化,特別是在多中心研究中(Assfalg等人,2008; Bernini等人,2009)。檢查激素的研究與子宮內(nèi)膜有重要關(guān)系,除了傳統(tǒng)的血液樣本之外,還有一些研究人員研究了非侵入性標(biāo)本,包括唾液和尿液(Shirtcliff等,2001)。非侵入性測試對臨床研究特別有興趣,未來工作預(yù)計(jì)將更多地集中在他們身上。

關(guān)于用于EC研究(SOP-ECBS)的組織和液體的收集,處理和儲存的標(biāo)準(zhǔn)操作程序的最終一致意見的結(jié)果細(xì)節(jié)如表4和圖2所示。關(guān)于用戶的一般性協(xié)議友好和工具的相關(guān)性。少數(shù)小組成員回答說,為了清楚起見,可以進(jìn)一步修改組織和血液收集細(xì)節(jié)??傮w上,83.75%的小組成員同意,8.75%未定,7.5%不同意這一工具的不同部分。


討論


我們已經(jīng)開發(fā)了以證據(jù)為基礎(chǔ)的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)收集表格ECPD,ECSD(最小),ECSD(標(biāo)準(zhǔn))和SOP-ECBS,包括所有利益相關(guān)者在EC癌癥生物樣品庫中的參與和批準(zhǔn)。最終的工具被一個(gè)大型的多學(xué)科評審小組批準(zhǔn),達(dá)成一致后(見補(bǔ)充圖S1),它們作為補(bǔ)充信息公布在這個(gè)開放存取手稿中。因此,他們將免費(fèi)向國際上所有的歐盟研究人員提供。這些工具提供了一種減少收集數(shù)據(jù)中的混雜因素并促進(jìn)更大型多中心研究的方法。

我們選擇要收集的確切信息是基于對最佳現(xiàn)有證據(jù)的批判性評估。沒有公開證據(jù)的地方,考慮了專家意見和較大生物庫的SOPs的咨詢。處理血液的離心速度就是這樣一個(gè)例子。

我們使用了一種修改后的德爾菲技術(shù),該標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)具有多項(xiàng)改進(jìn),包括多輪反饋,允許相同的小組成員重新評估或重新考慮初步判斷,參與者匿名性,受控反饋和統(tǒng)計(jì)分析以解釋輪次之間的數(shù)據(jù)。以前已經(jīng)使用了與原始德爾福系統(tǒng)相似的變化,例如限制專家對專家組的原始問題和變更的響應(yīng)能力以及改變終點(diǎn)的能力(Thompson,2009)。


對于我們的研究目的,反復(fù)使用同質(zhì)小組是不合理的,原因如下。我們的努力是為不同的終點(diǎn)產(chǎn)生單獨(dú)的形式,例如患者數(shù)據(jù)收集,手術(shù)數(shù)據(jù)收集,組織處理信息和標(biāo)準(zhǔn)手術(shù)程序。這些明顯需要不同背景的小組成員,具有不同的專業(yè)領(lǐng)域,因此我們的小組成員不是一個(gè)同質(zhì)的組織。

與經(jīng)典技術(shù)的主要偏差是咨詢輪次數(shù)和終點(diǎn)數(shù)。我們的前兩輪是描述性的,以產(chǎn)生不同專家組的意見和想法。我們包括他們的反饋,以產(chǎn)生最終的表格和SOP。在最后一輪的協(xié)商一致意見中,我們向每個(gè)小組成員分發(fā)了一張表格,并附上表格,評估他們與最終工具的協(xié)議。我們的最后一個(gè)小組包括所有以前小組參與的利益相關(guān)者。通過對從第三輪和最后一輪獲得的數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析觀察到的高比例的協(xié)議排除了進(jìn)一步的共識輪回的需要。

更詳細(xì)的是,標(biāo)準(zhǔn)化的手術(shù)數(shù)據(jù)收集將可以全面評估外科表型數(shù)據(jù)與治療結(jié)果之間的關(guān)系,我們強(qiáng)烈建議使用標(biāo)準(zhǔn)而不是最小的ECSD工具。但是,如果無法保證大量數(shù)據(jù)或樣本的收集或質(zhì)量,則應(yīng)采用最小集合。我們計(jì)劃通過反饋和未來文獻(xiàn)綜述獲取的信息,定期更新這些工具,最初是每年5年,之后5年。在我們的舉措范圍內(nèi)的未來考慮包括建立一個(gè)國際資助的基于網(wǎng)絡(luò)的中央數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),允許自愿將信息存儲在全球范圍內(nèi)的歐洲研究組織研究人員收集的所有生物樣本信息中。我們認(rèn)為,這種方法可以降低各個(gè)單位的成本和時(shí)間,同時(shí)增加生成的數(shù)據(jù)的可信度,并為更新的協(xié)作提供一個(gè)透明的通用平臺。

“分子病理流行病學(xué)”(MPE)整合了病理學(xué)和流行病學(xué),以了解影響癌癥發(fā)生,進(jìn)展和治療反應(yīng)的外源性和內(nèi)源性因素之間的相互關(guān)系。它是癌癥研究中不斷發(fā)展的領(lǐng)域(Ogino和Stampfer,2010)。還開發(fā)了統(tǒng)計(jì)學(xué)方法來考慮分子病理學(xué)和流行病學(xué),以確保具有高臨床影響的新發(fā)現(xiàn)。然而,與傳統(tǒng)的分子生物學(xué)研究(Hughes等人,2012; Campbell等,2017)相似的類似挑戰(zhàn),包括選擇和回憶偏倚,測量誤差和錯(cuò)誤分類,這些高度影響的MPE研究的產(chǎn)生受到阻礙。組織檢索率和樣本量的變異性導(dǎo)致隨機(jī)和非隨機(jī)選擇偏倚,導(dǎo)致效應(yīng)估計(jì)與寬置信區(qū)間和出版偏倚的巨大差異(Ogino等,2011,2016)。 EC生物庫使用我們的工具將提供一種手段,簡化從表型良好的患者中收集大量標(biāo)準(zhǔn)化的質(zhì)量保證材料。這將反過來促進(jìn)充分動力的研究,提供高臨床影響,同時(shí)也促進(jìn)在可接受的時(shí)間范圍內(nèi)可達(dá)到的高質(zhì)量研究。




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