生物樣品庫(Biobanks)是在最近30年內興起的一項生物科技產業(yè), 在2009年被時代雜志稱為影響世界的十大想法之一【1】。 生物樣品庫專注于各項生物醫(yī)學樣品的收集、儲存和共享,
對于現代生物醫(yī)學的科研、診斷、治療方面,都有積極的推動作用。
和液體活檢這個井噴式的朝陽產業(yè)相比,
生物樣品庫起步更早但是發(fā)展平緩, 最近的統(tǒng)計表明, 即使在美國和歐洲這樣的生物樣品庫發(fā)達的地區(qū), 生物樣品庫也是鮮為人知的專業(yè)概念, 在中國就更是不為人知了。
為此,我們在本期的《液體活檢通訊》里專門介紹一下生物樣品庫。
生物樣品庫和我們所積極關注的液體活檢,
是兩個相互獨立、相互作用的產業(yè), 一方面液體活檢的樣品, 無論在檢測前或是檢測后,都有越發(fā)增加的需求需要進入生物樣品庫, 生物樣品庫成為液體活檢的延伸。 另一方面,
生物樣品庫在生物標記物和個體化醫(yī)療和等方面的進步, 又推動了液體活檢在概念和實踐方面的進展。 而生物樣品庫所面臨的挑戰(zhàn), 無論是管理、經濟、倫理、法律,還是其他方面,都直接或間接地影響到液體活檢行業(yè)。
生物樣品庫的概念和淵源
現代醫(yī)學的核心思想是循證醫(yī)學(evidence-based medicine),又稱實證醫(yī)學,就是統(tǒng)一利用科學方法獲取證據,來確認診斷和醫(yī)療的成效。循證醫(yī)學所追溯的這些證據,包括早期的病理學樣品為主的組織樣本,和近年來針對分子診斷技術的更為精細劃分的血細胞、核酸等樣本,構成了循證醫(yī)學的基石。
我們這些在IVD行業(yè)的從業(yè)人員, 包括我們研發(fā)、推廣儀器、試劑盒耗材的同事們, 都是服務于醫(yī)學證據,依靠這些醫(yī)學證據來吃飯的。
而這些醫(yī)學證據的匯總, 就構成了各類生物樣品庫【2-9】。
一般來說,生物樣品庫包含這些三類內容:
第一類,實體部分, 是來自人體的生物學樣品;
第二類,來自第一類內容的相關信息, 包括診斷和分析結果;
第三類,和前兩類內容相關的倫理、法律信息。
其中的第一類, 即來自人體的生物學樣品, 是生物樣品庫的實體部分,
它包括全血、血漿、血清、紅細胞、白細胞、樣簽刮取物、DNA、RNA、蛋白質、細胞系、尿液、腦脊髓液、關節(jié)潤滑液,羊水、血沉棕黃層、骨髓干細胞、組織樣品等。 在目前情況下,
儲存量最大、最常用的樣品是組織樣品, 就是固定包埋或者冷凍保存的的組織樣品。 這是組織活檢的產物, 傳統(tǒng)操作里這些組織也是要求保留的, 所以有著天然的存量。 在近年發(fā)展最快的應該是血液樣品,
包括以上所提到的全血、血細胞和提取物, 這是液體活檢的產物。
生物樣品庫的現狀和種類
生物樣品庫的現狀可以這樣來概況:
多種門類, 亟待協調, 發(fā)展迅速, 面臨挑戰(zhàn)。 生物樣品部不是一家或者一種機構,而是上百種機構。
生物樣品庫的門類和形式是非常多樣化的。
從行政附屬上看, 生物樣品庫涵蓋了政府機構、醫(yī)院、高校和研究所、私立公司創(chuàng)辦的樣品機構。 從盈利角度看, 生物樣品庫有非盈利型和盈利型的, 從樣品覆蓋上看, 有覆蓋多個領域的綜合型和只覆蓋某個領域的專項型樣品庫。
根據最新的國際生物樣品庫目錄【9】, 生物樣品庫在北美和歐洲各有100家以上,
在亞洲有22家, 其中中國有三家。 這些都是正規(guī)的、門類齊全的綜合型生物樣品庫。
除了生物樣品庫本身,
還有為此服務的生物樣品庫中介公司(Biobank Brokers), 這是機構大多是商業(yè)公司,
利用生物樣品庫的信息共享渠道, 建立了自己的樣品目錄, 利用自己的渠道來推廣生物樣品庫的樣品, 中介有的也有自己的產品, 但是大多數沒有自己的產品。 可以肯定的是中介的目錄要遠大于自己有的樣品。
這些中介在最近幾年內在歐美迅速發(fā)展, 這個現象從商業(yè)角度說明了生物樣品庫有市場需求和盈利空間。
面臨挑戰(zhàn),前景寬廣
生物樣品庫作為一個新的產業(yè),
目前面臨著三大挑戰(zhàn)。
第一,
倫理和法律方面;
第二,
管理和規(guī)范;
第三,
運營、資金支持和可持續(xù)性。
在倫理和法律方面,
生物樣品庫引發(fā)了非常多的討論, 歸根結底這些討論聚焦在患者個體的私密信息保護、分享權以及這些信息和權力的轉讓和商業(yè)化處理上【10-17】。
隨著分子生物學的進展、大規(guī)模測序技術和大數據技術的進步, 這些問題可能引發(fā)激烈的辯論和不確定性。 在這個方面, 生物樣品庫的信息部分比它的實體部分更加引人關注。
在管理和規(guī)范方面,
因為生物樣品庫的門類繁多, 在各個不同的機構、地區(qū)、國家、國際機構里, 都有不同的操作和標準, 因此在管理方面的首要任務是協調各類標準以達成共識【18-24】。
在運營方面,各類生物樣品庫是否有足夠的資金支撐,是否可持續(xù)運營,
也是一大挑戰(zhàn)。 目前大部分的生物樣品庫所面向的市場是科研, 所以生物樣品庫基本上也是靠著科研基金來支撐, 還沒有做到自我造血和獨立存活, 也沒有進入商業(yè)運營模式。
和液體活檢相輔相成
生物樣品庫的存在和發(fā)展,
顯著地推動了生物標記物的開發(fā)和確認, 繼而推動了以生物標記物為基礎的癌癥檢測和治療的領域【25-33】。 癌癥的診療目前已經進入分子水平,
人們充分接受了這樣的醫(yī)學事實, 就是癌癥是上百種不同的病種的總和, 而每一種癌癥都有獨特的檢測方案, 這些檢測方案和特定的癌癥所呈現出的生物標記為的組合是直接相關的。
雖然FDA迄今為止只批準了少數的生物標記物作為明確接受的癌癥診斷依據(比如EGFR突變來診斷非小細胞肺癌),
但是在科研領域有大量的生物標記物及其組合, 已經成為診斷各類癌癥的首選方法。
這些生物標記物不是靜態(tài)存在,而是動態(tài)變化的,
不停地有新的生物標記物被發(fā)現、評估和確認, 這些發(fā)現、評估和確認的過程, 是離不開生物樣品庫的推動的。 生物標記物的發(fā)現,可以是在基礎研究的實驗室內, 一旦發(fā)現的過程完成了,
即進入臨床確認階段, 如果沒有生物樣品庫來提供大量的特定類型的癌癥樣品, 這個臨床確認過程將通過招募患者來啟動臨床研究來完成, 那將是非常昂貴和漫長的。 所以說,生物樣品庫顯著地推動了生物標記物的開發(fā)和確認。
生物樣品庫的存在和發(fā)展,
也顯著地推動了個體化醫(yī)療的發(fā)展【34-44】。 癌癥的高突變性決定了癌癥的診斷和治療必將是在個體基礎上的, 個體化醫(yī)療的最合適的領域正是癌癥領域。
對于每一個患者, 腫瘤的發(fā)生、復發(fā)和消退的動態(tài)變化, 都應該記錄在按, 每一次的取樣和儲存, 如果是血液樣品, 即是液體活檢操作。 這些液體活檢的樣品在完成檢測后,
不是要丟棄而是要進入生物樣品庫, 成為這名患者的個體化診療的留樣。 這樣, 生物樣品庫成為了液體活檢的延伸, 也為專注于樣品采集和儲存的樣品專家們,提出了新的挑戰(zhàn),
因為這時的樣品儲存有了更高的要求, 不再是穩(wěn)定幾天和幾星期, 而是穩(wěn)定幾年或更久。
通過生物標記物和個體化診療這兩個概念,
生物樣品庫和液體活檢互相重疊, 互補促進,相輔相成。
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